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Anthropic表示,Claude发现了一种具有类CRISPR重复序列的新酶系统

Anthropic 表示,Claude 在噬菌体(感染细菌的病毒)的 DNA 中发现了一个此前未被描述的酶系统。在该酶的基因旁边,有一长段重复的 DNA,类似于 CRISPR 阵列。该公司目前尚不清楚该系统的功能。

Anthropic 周三通过一篇博客文章和一份未经同行评审的预印本公布了这一结果。这是该公司内部新成立的分子生物学小组和实验室的首个成果。该团队将该系统命名为阵列相关逆转录酶,简称 ART。

Claude 的发现逆转录酶是一种将 RNA 复制为 DNA 的酶。细菌常利用这些酶来抵御病毒。ART 由三部分组成:该酶、其旁边的一个伙伴基因,以及一个由均匀间隔的 DNA 重复序列组成的阵列。

这种布局让人联想到 CRISPR,后者的阵列存储着一组不同的 RNA 向导。根据预印本,ART 阵列包含 3 到 21 个短重复序列的拷贝。它们附近均没有 CRISPR 系统所携带的 cas 基因。

在实验室测试中,Anthropic 的科学家发现,该阵列被转录为一组不同的短 RNA。在一项关于金黄色葡萄球菌噬菌体的已发表数据中,这些 RNA 在感染后 15 分钟占到了噬菌体 RNA 的 8%。预印本指出,团队尚未证明该酶具有活性,或其能作用于这些 RNA。

Anthropic 表示,已知系统中仅有极少数具备这一组特征。所有这些系统都能切割、复制或插入 DNA。

搜索过程团队仅给 Claude 下达了一个研究简报:在一个包含 19 亿个蛋白质簇的数据库中寻找新的逆转录酶系统。运行 Claude Mythos 5 的智能体完成了其余工作。一个智能体负责规划并执行每项任务,另一个负责审查,并在过程中根据需要开启新任务。

预印本论文显示,该项研究在没有人类干预的情况下运行了21.5小时,跨越了949个智能体(agent)会话,消耗了2.156亿个词元(token)。智能体恢复了大约20万个酶簇,对3564个候选伴侣家族进行了评分,并提交了19份报告供人类审查。

ART来自一条旁支路径。一个在不寻常的酶旁边阅读原始DNA的智能体写道,它可以“凭肉眼”看到重复模式。随后,它计算了重复次数,将其与已知系统进行了对比,并检索了相关文献,然后才提交了报告。

麻省理工学院和布罗德研究所的CRISPR先驱张锋审阅了这篇预印本论文。Anthropic在其发布的文章中附上了他的评论。

张锋表示:“识别与逆转录酶相关的RNA重复序列阵列确实非常有趣,值得进一步研究。”

目前尚未明确的是,该酶本身并非新发现。Anthropic称,早期研究已经识别出了它,而Claude似乎是第一个发现该阵列和伴侣蛋白质的系统。预印本论文指出,关于某个ART噬菌体的第一份基因组报告描述了该酶,但没有提及重复序列或伴侣基因。

这一发现也很难重复。Anthropic将相同的研究又运行了十次。没有任何一次重跑读取了该酶上游的DNA,且全部十次都错过了该阵列。作者将此归咎于搜索的规模以及智能体不可预测的行为。

在固定测试中,当直接获得DNA时,Anthropic能力最强的四个模型在至少90%的尝试中都描述了该阵列。但在配合文件和工具使用时,这一比例骤降至32%。通常情况下,模型读取的DNA根本不足以看到完整的重复序列。

研究团队还观察了Mythos 5在读取该序列时的内部情况。就在智能体给重复序列命名之前,两个内部信号在重复序列上触发了。Anthropic以前曾构建过用于研究Claude未说出口的想法的工具。

该实验室背后的公司Anthropic于2026年春季组建了该小组。公司表示,其位于湾区的实验室仅在生物安全等级1和2下运作,不处理任何感染人类的病原体。所有实验室工作均由人类科学家完成。该团队使用Claude Code和Claude Science,这两款工具由Anthropic于6月推出。

该小组隶属于Anthropic的生命科学部门,该部门同时也从事药物发现工作。Anthropic于4月以4亿美元收购了Coefficient Bio。OpenAI在同一个月推出了GPT-Rosalind,这是一个用于生命科学研究的模型。

Anthropic表示,目前正在进行更多实验以了解ART的功能。该公司正邀请其他科学家提交研究提案。